Działalność naukowa jest, obok dydaktyki, jedną z najważniejszych funkcji uczelni. Jej treść i wyniki zasilają skutecznie proces dydaktyczny oraz decydują o poziomie kadr naukowych. Od początku działalności SWPS podkreślała swój akademicki charakter i podejmowała działania w zakresie prowadzenia badań naukowych.

Od roku 2000 pracownicy SWPS aktywnie uczestniczą w konkursach o dofinansowanie projektów badawczych własnych i promotorskich (grantów badawczych) przez Ministerstwo Nauki i Szkolnictwa Wyższego. Tylko w ostatnim rozstrzygniętym konkursie SWPS przyznano finansowanie 7 nowych projektów badawczych. Łącznie w Szkole realizowanych jest obecnie 40 projektów badawczych w tym 16 promotorskich.

W 2002 roku Szkoła jako jedna z pierwszych szkół niepaństwowych w Polsce, otrzymała dotacje w ramach finansowania badań własnych. Dotację na badania własne przyznaje się w oparciu o ocenę prowadzonej przez uczelnie działalności badawczej oraz rozwoju młodej kadry naukowej.

W 2003 roku Komitet Badań Naukowych (obecnie Ministerstwo Nauki i Szkolnictwa Wyższego) przeprowadził tzw. ocenę parametryczną Wydziału Psychologii SWPS. Otrzymanie kategorii KBN wiązało się z pozytywną oceną działalności naukowej pracowników uczelni: punktowanych publikacji naukowych, wystąpień konferencyjnych oraz kształcenia i rozwoju kadry naukowej.

W konsekwencji od 2003 uczelnia otrzymuje, jako jedna z zaledwie kilku uczelni niepublicznych, dotacje na badania statutowe w zakresie psychologii.

Od roku 2007 dotację na podstawową działalność statutową otrzymują również Wydział Nauk Humanistycznych i Społecznych oraz Wydział Filologiczny.

Od roku 2002 SWPS ma prawo przyznawania stopnia doktora nauk humanistycznych i we współpracy z Instytutem Psychologii Polskiej Akademii Nauk prowadzi studia doktoranckie w dziedzinie psychologii.

Ponadto, jako jedna z nielicznych szkół niepublicznych decyzją Centralnej Komisji ds. Stopni i Tytułów z 30 maja 2005 roku SWPS otrzymała uprawnienia do nadawania stopnia naukowego doktora habilitowanego nauk humanistycznych w dyscyplinie psychologia.

11 kwietnia 2007 r. Centralna Komisja do Spraw Stopni i Tytułów przyznała Wydziałowi Nauk Humanistycznych i Społecznych uprawnienia do nadawania stopnia naukowego doktora nauk humanistycznych w dyscyplinie kulturoznawstwo.

SWPS uczestniczy także w programach badawczych w ramach VI i VII Programu Ramowego Komisji Europejskiej.